Aspergillus (Čeština)

A., nidulans (Emericella nidulans) byl použit jako výzkumný organismu po mnoho let a byl používán Guido Pontecorvo prokázat parasexuality v houbách. Nedávno byl a. nidulans jedním z průkopnických organismů, které vědci z Broad Institute sekvenovali svůj genom. V roce 2008, dalších sedm druhů Aspergillus měli jejich genom sekvenován: průmyslově užitečné, A. niger (dva kmeny), A. oryzae, a. terreus, a patogeny. A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus, a. fumigatus (dva kmeny). A., fischerianus je stěží někdy patogenní, ale je velmi úzce spjat s běžným patogenem a.fumigatus; částečně byl sekvenován, aby lépe porozuměl patogenitě a. fumigatus.

sexuální reprodukceedit

z 250 druhů aspergilli, asi 64% nemá žádný známý sexuální stav. Mnoho z těchto druhů však pravděpodobně má dosud neidentifikovanou sexuální fázi. Sexuální reprodukce se u hub vyskytuje dvěma zásadně odlišnými způsoby., Tyto jsou připařování (v heterothallic houby), ve které jsou dvě různé osoby přispívají jádra, a self-fertilizace, nebo samosprášení (v homothallic houby), v níž obě jádra jsou odvozena od téhož jedince. V posledních letech, sexuální cykly byly objeveny u mnoha druhů dříve považovaných za asexuální. Tyto objevy odrážejí nedávné experimentální zaměření na druhy zvláštního významu pro člověka.

a.fumigatus je nejčastějším druhem způsobujícím onemocnění u imunodeficientních lidí. V roce 2009 bylo prokázáno, že a.fumigatus má heterothalický, plně funkční sexuální cyklus., Izoláty komplementárních typů páření jsou nutné pro sex dojít.

a. flavus je hlavním producentem karcinogenních aflatoxinů v plodinách po celém světě. Je to také oportunní lidský a živočišný patogen, který způsobuje aspergilózu u imunokompromitovaných jedinců. V roce 2009 bylo zjištěno, že sexuální stav této heterothalické houby vzniká, když byly kmeny opačných typů Páření kultivovány společně za vhodných podmínek.

a. lentulus je oportunní lidský patogen, který způsobuje invazivní aspergilózu s vysokou úmrtností. V Roce 2013, A., bylo zjištěno, že lentulus má heterothalický funkční systém pohlavního rozmnožování.

a. terreus se běžně používá v průmyslu produkují důležité organické kyseliny a enzymy, a byl počáteční zdroj pro cholesterol-snížení léků lovastatin. V roce 2013 bylo zjištěno, že a.terreus je schopen sexuální reprodukce, když byly za vhodných podmínek kultury překročeny kmeny opačných typů Páření.,

Tato zjištění s Aspergillus jsou v souladu se hromadí důkazy, ze studií jiných eukaryotických druhů, že sex je pravděpodobně přítomna u společného předka všech eukaryot.

a. nidulans, homothalická houba, je schopna samooplodnění. Samosprášení zahrnuje aktivaci stejné páření drah charakteristické sex v připařování druhů, tj. self-hnojení není nutné obejít cesty pro připařování sex, ale místo toho vyžaduje aktivace těchto drah v rámci jednoho jedince.,

mezi druhy Aspergillus, které vykazují sexuální cyklus, je převážná většina V přírodě homothalická (samooplodnění). Toto pozorování naznačuje, že druhy Aspergillus mohou obecně udržovat sex, i když malá genetická variabilita je produkována homothalickým samooplodněním. A., fumigatus, heterothallic (připařování) houba, která se vyskytuje v oblastech s velmi odlišné podnebí a prostředí, také zobrazuje malé genetické variability, a to buď v rámci geografických regionů nebo v celosvětovém měřítku, což opět naznačuje, sex, v tomto případě připařování sex, může být zachována, i když malá genetická variabilita je produkován.

GenomicsEdit

současné zveřejnění tři genomu Aspergillus rukopisy v Přírodě v prosinci 2005 založil rod jako vedoucí vláknité houbové rodu pro komparativní genomické studie., Stejně jako většina velkých genomových projektů byly tyto snahy spoluprací mezi velkým sekvenačním centrem a příslušnou komunitou vědců. Například Institut pro výzkum genomu (TIGR) spolupracoval s komunitou a.fumigatus. A. nidulans byl sekvenován v širokém Institutu. A. oryzae byl sekvenován v Japonsku na Národním institutu pokročilých průmyslových věd a technologií. Společný genomový ústav Ministerstva energetiky zveřejnil sekvenční údaje pro kmen a. nigera produkující kyselinu citronovou. TIGR, nyní přejmenovaný na J., Craig Venter Institute, v současné době vede projekt genomu a.flavus.

Aspergillus se vyznačuje vysokou úrovní genetické rozmanitosti a pomocí protostome divergence jako měřítko, je tak rozmanité jako Obratlovci, kmen, i když obě inter a intra-specifické struktury genomu je relativně plastická. Genomy některých druhů Aspergillus, jako jsou A. flavus, a. oryzae, více bohaté a kolem 20% větší než jiné, například A. nidulans a a. fumigatus., Tento rozdíl by mohlo vysvětlit několik mechanismů, ačkoli kombinace segmentové duplikace, duplikace genomu a horizontálního přenosu genů působících po částech je dobře podporována.

velikost Genomu pro sekvenovaných druhů Aspergillus v rozmezí od asi 29.3 Mb pro a. fumigatus, aby 37.1 Mb pro a. oryzae, zatímco počty predikovaných genů se liší od o 9926 pro a. fumigatus, aby o 12,071 pro a. oryzae. Velikost genomu enzymatického kmene a. niger má střední velikost při 33, 9 Mb.