Mnoho bílkovin „bind“ DNA přes pozitivně nabité aminokyseliny na jejich povrchu. Nicméně, k překonání významné energetické a topologické překážky, proteiny, které se ohýbají nebo balíček DNA může také modulovat tuhost, která je generována repulsions mezi fosfáty v DNA., Moc předchozí práce popisuje, jak ionty změnit flexibilitu DNA v roztoku, ale při zvažování makromolekul, jako jsou chromatinu, v němž DNA kontakty nucleosome jádro každé kolo dvojité šroubovice, to může být vhodné posoudit flexibilitu DNA na nabité povrchy. Slída potažená pozitivně nabitými molekulami je vhodným substrátem, na kterém může být flexibilita DNA přímo měřena mikroskopem skenovací síly., V níže popsaných experimentech se flexibilita DNA zvýšila až pětinásobně v závislosti na koncentraci a typu polyaminu použitého k potahování slídy. Pomocí teorie, která se týká neutralizace náboje k flexibilitě, předpovídáme, že odpuzování fosfátů bylo oslabeno o ∼50% v nejflexibilnější pozorované DNA. Tato jednoduchá metoda je důležitým nástrojem pro zkoumání fyziochemických příčin a molekulárně biologických účinků flexibility DNA, která ovlivňuje biochemii DNA od stability chromatinu po virové zapouzdření.
Napsat komentář