Fire-tre-dage-gamle Aspergillus kolonier. Med uret fra øverste venstre: en A. nidulans laboratorium stamme; en lignende stamme med en mutation i yA markør-gen, der er involveret i grøn pigmentering; en A. oryzae stamme, der anvendes i soja gæring; A. oryzae RIB40
En scanning af Aspergillus taget på 235 forstørrelser under et scanning elektron mikroskop
A., nidulans (Emericella nidulans) har været anvendt som et forsknings-organisme i mange år, og blev brugt af Guido Pontecorvo til at demonstrere parasexuality i svampe. For nylig var A. nidulans en af de banebrydende organismer, der fik sit genom sekventeret af forskere ved Broad Institute. Fra 2008 har yderligere syv Aspergillus-arter haft deres genomer sekventeret: den industrielt nyttige A. niger (to stammer), A. ORY .ae og A. terreus og patogenerne A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus og A. fumigatus (to stammer). A., fischerianus er næppe nogensinde patogen, men er meget tæt knyttet til det fælles patogen A. fumigatus; det blev delvist sekventeret for bedre at forstå A. fumigatus patogenicitet.
seksuel reproductionEdit
af de 250 arter af aspergilli har omkring 64% ingen kendt seksuel tilstand. Imidlertid, mange af disse arter har sandsynligvis et endnu uidentificeret seksuelt Stadium. Seksuel reproduktion forekommer på to fundamentalt forskellige måder i svampe., Disse er outcrossing (i heterothallic svampe), hvor to forskellige individer bidrage kerner, og selv-befrugtning eller selvbestøvning (i homothallic svampe), hvor begge kerner er afledt fra den samme person. I de senere år er seksuelle cyklusser blevet opdaget hos adskillige arter, der tidligere blev antaget at være aseksuelle. Disse opdagelser afspejler nylige eksperimentelle fokus på arter af særlig relevans for mennesker.
A. fumigatus er den mest almindelige art, der forårsager sygdom hos immundefektive mennesker. I 2009 blev A. fumigatus vist at have en heterotallisk, fuldt funktionel seksuel cyklus., Isolater af komplementære parringstyper er nødvendige for at se.kan forekomme.
A. flavus er den største producent af kræftfremkaldende aflatoksiner i afgrøder over hele verden. Det er også et opportunistisk menneske-og dyrepatogen, der forårsager aspergillose hos immunkompromitterede individer. I 2009 viste det sig, at en seksuel tilstand af denne heterotalliske svamp opstod, når stammer af modsatte parringstyper blev dyrket sammen under passende forhold.
A. lentulus er et opportunistisk humant patogen, der forårsager invasiv aspergillose med høj dødelighed. I 2013 Skrev A., lentulus viste sig at have et heterotallisk funktionelt seksuelt avlssystem.
A. terreus bruges ofte i industrien til at producere vigtige organiske syrer og en .ymer og var den oprindelige kilde til det kolesterolsænkende lægemiddel lovastatin. I 2013 viste A. terreus sig at være i stand til seksuel reproduktion, når stammer af modsatte parringstyper blev krydset under passende kulturbetingelser.,
disse fund med Aspergillus-arter er i overensstemmelse med akkumulerende bevis fra undersøgelser af andre eukaryote arter, at køn sandsynligvis var til stede hos den fælles stamfar til alle eukaryoter.
A. Nidulans, en homotallisk svamp, er i stand til selvbefrugtning. Selvbestøvning indebærer aktivering af den samme parring veje karakteristisk for sex i outcrossing arter, dvs selvbestøvning ikke omgå nødvendige veje til outcrossing sex, men i stedet kræver aktivering af disse veje inden for en enkelt person.,
blandt de Aspergillus-arter, der udviser en seksuel cyklus, er det overvældende flertal i naturen homotalliske (selvbefrugtende). Denne observation antyder, at Aspergillus-arter generelt kan opretholde se., selvom lidt genetisk variation produceres ved homotallisk selvbefrugtning. A., fumigatus, en heterothallic (outcrossing) – en svamp, der forekommer i områder med vidt forskellige klimaer og miljøer, viser også lidt genetisk variation enten inden for geografiske regioner, eller på en global skala, igen tyder på sex, i dette tilfælde outcrossing sex, kan opretholdes, selv når lille genetisk variation er produceret.
GenomicsEdit
den samtidige offentliggørelse af tre Aspergillus-genommanuskripter i Nature i December 2005 etablerede slægten som den førende trådformede svampeslægt til sammenlignende genomiske undersøgelser., Som de fleste større genomprojekter, disse bestræbelser var samarbejde mellem et stort sekventeringscenter og det respektive samfund af forskere. For eksempel arbejdede Institut for genomforskning (TIGR) med A. fumigatus-samfundet. A. nidulans blev sekventeret på Broad Institute. A. ORY .ae blev sekventeret i Japan ved National Institute of Advanced Industrial Science and Technology. Det fælles Genominstitut for Energiministeriet har frigivet sekvensdata for en citronsyreproducerende stamme af A. niger. TIGR, nu omdøbt til J., Craig Venter Institute, er i øjeblikket i spidsen for et projekt om A. flavus genomet.
Aspergillus er kendetegnet ved høje niveauer af genetisk mangfoldighed og er ved hjælp af protostomdivergens som en skala lige så forskelligartet som hvirveldyrets phylum, selvom både inter-og intra-specifik genomstruktur er relativt plastisk. Genomer af nogle Aspergillus-arter, såsom A. flavus og A. oryzae, er mere rig, og omkring 20% større end andre, såsom A. nidulans og A. fumigatus., Flere mekanismer kunne forklare denne forskel, selvom kombinationen af segmental duplikering, genom-duplikering og horisontal genoverførsel, der virker stykkevis, er godt understøttet.
Genom størrelser for sekventeret arter af Aspergillus spænder fra omkring 29.3 Mb for A. fumigatus til 37.1 Mb for A. oryzae, mens antallet af forventede gener varierer fra omkring 9926 for A. fumigatus til om 12,071 for A. oryzae. Genomstørrelsen af en en .ymproducerende stamme af A. niger er af mellemstørrelse ved 33, 9 Mb.
Skriv et svar