Neanderthal-DNA fremhæver kompleksiteten af COVID risikofaktorer

posted in: Articles | 0

En vigtig del af håndteringen af COVID-19 er forståelse for, hvorfor nogle mennesker oplever mere alvorlige symptomer end andre. Tidligere i år viste det sig, at et segment af DNA 50,000 nukleotider lang (svarende til 0, 002% af det humane genom) havde en stærk tilknytning til svær COVID-19-infektion og indlæggelse1. Writingeberg og P .bobo2 skriver i naturen, at denne region er arvet fra neandertalerne., Deres resultater kaster ikke kun lys over en grund til, at nogle mennesker er mere modtagelige for alvorlig sygdom, men giver også indsigt i menneskelig evolutionær biologi.

DNA-sekvenser, der er fysisk tæt på hinanden i genomet, arves ofte (forbundet) sammen. Disse blokke af DNA, kendt som haplotyper, indeholder derfor tæt forbundne varianter — DNA-sekvenser eller nukleotider, der varierer mellem individer i en population., For eksempel covid-19 risiko haplotype beskrevet tidligere i år1 havne varianter på tværs af hele sin 50,000-nukleotid spændvidde, der er nedarvet sammen mere end 98% af tiden. Lange haplotyper som denne kunne være et resultat af positiv Udvælgelse, opretholdt i vores genomer, fordi de bidrog til vores Arts chancer for overlevelse og reproduktiv succes. De kunne også introduceres som et resultat af krydsning med arkaiske homininarter som Denisovans og Neanderthals.1-4% af det moderne menneskelige genom kommer fra disse gamle slægtninge3., Mange af de overlevende arkaiske gener er skadelige for moderne mennesker og er forbundet med infertilitet og en øget risiko for sygdom4. Men nogle få er gavnlige. Som eksempler kan nævnes den Denisovan-lignende version af et gen, kaldet EPAS1, der hjælper med moderne Tibetanere til at håndtere livet ved ekstremt høje altitudes5, en Neanderthal-gen, der øger vores følsomhed over for pain6 og andre, at hjælpe os med at afværge viruses7.,

for at undersøge, om covid-19-risikohaplotypen muligvis er blevet introduceret fra vores gamle slægtninge, sammenlignede regioneberg og p .bobo regionen med en online database med arkaiske genomer fra hele verden. De fandt, at regionen var tæt knyttet til det i genomet til et Neanderthal-individ, der boede i det moderne Kroatien for omkring 50,000 år siden, men det var ikke relateret til nogen kendte denisovan-genomer.forfatterne kontrollerede derefter forekomsten af den Neanderthal-afledte haplotype i den moderne menneskelige befolkning., De rapporterer, at det er sjældent eller helt fraværende i østasiater og afrikanere. Blandt latinamerikanere og europæere opretholdes risikohaplotypen med en beskeden frekvens (henholdsvis 4% og 8%). I modsætning hertil forekommer haplotypen med en frekvens på 30% hos personer, der har sydasiatisk aner, og når op til 37% hos dem med Bangladeshisk arv (fig. 1).

Figur 1 / ujævn global spredning af en genetisk risikofaktor for COVID-19., Zeberg og p .bobo2 rapporterer, at en lang sekvens af DNA, der er forbundet med alvorlig COVID-19-infektion og indlæggelse, stammer fra neandertalere. Sekvensen er ujævnt fordelt over moderne menneskelige populationer. Dette kort viser den frekvens, hvor risikofaktoren findes i forskellige populationer fra hele verden. Sekventeringsdataene for disse populationer blev indsamlet af 1000 genomer Project10. (Tilpasset fra Fig. 3 af ref. 2.,)

forskerne derfor med at spekulere på, at Neanderthal-afledte haplotype er en væsentlig bidragyder til COVID-19 risiko i specifikke grupper. Deres hypotese er understøttet af hospitalet data8 fra Office for National Statistics i det Forenede Kongerige, hvilket indikerer, at personer i Bangladesh oprindelse i det land, er dobbelt så tilbøjelige til at dø af COVID-19, som er medlemmer af den almindelige befolkning (selv om andre risikofaktorer, selvfølgelig, bidrager til denne statistik).,

hvorfor er denne haplotype blevet bevaret i nogle populationer? Forfatterne hævder, at det kan være beskyttende mod andre gamle patogener, og derfor positivt udvalgt til i visse populationer rundt om i verden9. Men når individer er inficeret med SARS-cov-2 coronavirus, kan det beskyttende immunrespons medieret af disse gamle gener være alt for aggressivt, hvilket fører til det potentielt dødelige immunrespons observeret hos mennesker, der udvikler alvorlige COVID-19-symptomer., Som følge heraf kan en haplotype, som til tider i vores fortid kunne have været gavnlig for overlevelse, nu have en negativ virkning.

På trods af sammenhængen mellem denne risiko haplotype og kliniske resultater, bestemmer genetik alene ikke en persons risiko for at udvikle alvorlig COVID-19. Vores gener og deres oprindelse påvirker klart udviklingen og udviklingen af COVID-19 (og andre infektionssygdomme), men miljøfaktorer har også nøgleroller i sygdomsresultater.,

For eksempel, selv om Neanderthal-afledte risiko haplotype er næsten helt fraværende hos personer med Afrikansk afstamning, som denne befolkning har en højere COVID-19 dødelighed end personer af anden etnisk baggrund, selv efter justering for geografi og socio-økonomiske faktorer (se go.nature.com/3jcxezx (‘Demografiske oplysninger’ fanen) go.nature.com/2h4qfqu, for eksempel). Social ulighed og dens følger synes sandsynligvis at tegne sig for en større andel af risikoen for COVID-19-død end Neanderthal-afledt DNA.,

det er fascinerende at tro, at vores forfædres genetiske arv muligvis spiller en rolle i den nuværende pandemi. Imidlertid er den underliggende virkning af det arvede DNA på kroppens reaktion på virussen uklar. Igangværende globale indsats for at studere sammenhængen mellem vores genetik og COVID-19 ved at analysere flere individer fra forskellige populationer, som den, der er blevet foretaget af COVID-19-Vært Genetik Initiativ (www.covid19hg.org), vil hjælpe os til at udvikle en bedre forståelse af sygdommens ætiologi., Det er vigtigt at erkende, at selv om gener, der er involveret i COVID-19 svar kan være arvelige, sociale faktorer og adfærd (såsom social distancering og iført maske) er under vores kontrol, og der effektivt kan reducere risikoen for infektion.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret. Krævede felter er markeret med *