Neljä kolmen päivän vanha Aspergillus-pesäkkeitä. Myötäpäivään ylhäältä vasemmalta: A. nidulans laboratorio-kanta; samanlainen kanta mutaatio yA merkki geeni mukana vihreä pigmentti; A. oryzae siivilöi käytetty soija käyminen; A. oryzae RIB40
scan Aspergillus otettu 235 suurennoksia alle pyyhkäisyelektronimikroskoopilla
A., nidulans (Emericella nidulans) on käytetty tutkimus-organismi vuosia, ja käytti Guido Pontecorvo osoittaa parasexuality sienissä. Äskettäin, A. nidulans oli yksi uraauurtava organismien on sen genomia sekvenssoitiin tutkijoiden Laaja-Instituutti. Vuodesta 2008, lisäksi seitsemän Aspergillus-lajeja on ollut niiden geenit sekvensoitiin: n teollisesti käyttökelpoinen A. niger (kaksi kantaa), A. oryzae, ja A. terreus ja taudinaiheuttajia A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus ja A. fumigatus (kaksi kantaa). A., fischerianus on harvoin patogeeninen, mutta se on hyvin läheistä sukua yhteinen taudinaiheuttaja A. fumigatus; se oli tehty osittain ymmärtää paremmin, A. fumigatus patogeenisuus.
seksuaalinen lisääntymismedit
250 aspergillilajista noin 64%: lla ei ole tiedossa seksuaalista tilaa. Monilla näistä lajeista on kuitenkin todennäköisesti toistaiseksi tunnistamaton seksuaalinen vaihe. Suvullinen lisääntyminen tapahtuu sienissä kahdella täysin erilaisella tavalla., Nämä ovat outcrossing (vuonna heterothallic sienet), jossa kaksi eri yksilöiden osaltaan ytimet, ja itsensä lannoitus tai selfing (vuonna homothallic sienet), jotka molemmat ytimet ovat peräisin samasta yksilöstä. Viime vuosina, seksuaalinen syklit on löydetty lukuisia lajeja aiemmin ajateltu olevan suvuton. Nämä löydöt heijastavat viimeaikaista kokeellista keskittymistä lajeihin, joilla on erityistä merkitystä ihmisille.
A. fumigatus on yleisin laji, joka aiheuttaa sairauksia immuunipuutteisilla ihmisillä. Vuonna 2009 A. fumigatuksella osoitettiin olevan heterotallinen, täysin toimiva seksisykli., Sukupuolen syntymiseen tarvitaan toisiaan täydentävien parittelutyyppien isolaatteja.
A. flavus on maailmanlaajuisesti merkittävä karsinogeenisten aflatoksiinien tuottaja. Se on myös opportunistinen ihmisen ja eläimen taudinaiheuttaja, joka aiheuttaa aspergilloosia immuunipuutteisilla yksilöillä. Vuonna 2009, seksuaalinen valtion tämän heterothallic sientä todettiin syntyy, kun kantoja vastapäätä pariutumisen tyypit viljeltiin yhdessä sopivissa olosuhteissa.
A. lentulus on opportunistinen ihmisen taudinaiheuttaja, joka aiheuttaa invasiivista aspergilloosia, jossa kuolleisuus on suuri. Vuonna 2013 A., lentuluksella todettiin olevan heterotallinen toimiva seksuaalinen lisääntymisjärjestelmä.
A. terreus on yleisesti käytetty teollisuus tuottaa tärkeitä orgaanisia happoja ja entsyymejä, ja oli alkuperäinen lähde kolesterolia alentava lääke, lovastatiini. Vuonna 2013, A. terreus todettiin olevan kykenevä seksuaalinen lisääntyminen, kun kantoja vastapäätä pariutumisen tyypit olivat ristissä sopivissa kulttuuri ehtoja.,
Näiden tulosten kanssa Aspergillus-lajit, ovat yhdenmukaisia kertyvät todisteet, tutkimuksista, muiden eukaryoottisten lajien, että seksi oli todennäköisesti läsnä yhteinen esi kaikkien eukaryooteissa.
A. nidulans, homotallisieni, kykenee itse hedelmöittymään. Selfing liittyy aktivointi saman pariutumisen reittejä ominaisuus seksiä outcrossing lajeja, eli self-lannoitus ei ohittaa tarvitaan väyliä outcrossing seksiä, mutta sen sijaan vaatii aktivointi näitä polkuja yhden yksilön.,
niiden Aspergillus-lajien joukossa, joilla esiintyy seksuaalista kiertokulkua, ylivoimainen enemmistö luonnossa on homotallisia (itselannoittavia). Tämä havainto viittaa siihen, Aspergillus-lajeja voi yleensä ylläpitää seksiä vaikka vähän geneettinen vaihtelu on valmistettu homothallic itsensä lannoitus. A., fumigatus, on heterothallic (outcrossing) sieni, joka esiintyy alueilla, joilla on laajalti eri ilmasto-olosuhteissa ja ympäristöissä, myös näyttää vähän geneettistä vaihtelua joko sisällä maantieteellisillä alueilla tai maailmanlaajuisesti, taas viittaa siihen, sukupuoli, tässä tapauksessa outcrossing sukupuoli, voidaan säilyttää, vaikka vähän geneettinen vaihtelu on tuotettu.
GenomicsEdit
samanaikainen julkaiseminen kolme Aspergillus genomin käsikirjoituksia Luonnossa joulukuussa 2005 perustettu suvun johtava rihmamaisessa sieni-suvun vertaileva genomien tutkimukset., Kuten useimmat suuret genomihankkeet, nämä toimet olivat suuren sekvensointikeskuksen ja tutkijayhteisön yhteistyötä. Esimerkiksi, Institute for Genome Research (TIGR) työskenteli A. fumigatus yhteisön. A. nidulans sekvensoitiin Broad Institutessa. A. oryzae selvitettiin Japanissa National Institute of Advanced Industrial Science and Technology. Energiaministeriön yhteinen genomi-instituutti on julkaissut sekvenssitiedot A. Nigerin sitruunahappoa tuottavasta kannasta. TIGR, nyt nimeltään J., Craig Venter Institute johtaa parhaillaan A. flavuksen genomia koskevaa hanketta.
Aspergillus on ominaista korkea geneettinen monimuotoisuus ja käyttäen protostome eroja, kuten mittakaavassa, on yhtä monipuolinen kuin Selkärankaisten phylum vaikka sekä inter-ja intra-erityisiä genomin rakenne on melko muovinen. Genomien jotkut Aspergillus-lajit, kuten A. flavus ja A. oryzae, enemmän rikkaita ja noin 20% suurempi kuin toiset, kuten A. nidulans ja A. fumigatus., Useat mekanismit voisivat selittää tätä eroa, vaikka yhdistelmä segmentaalinen päällekkäisyyttä, genomin päällekkäisyyksiä, ja horisontaalinen geeninsiirto toimii hajanaisesti on hyvin tuettu.
Genomin kokoa sekvensoitiin Aspergillus-lajit vaihtelevat noin 29.3 Mb A. fumigatus 37,1 Mb A. oryzae, kun taas määrä ennusti geenit vaihtelevat noin 9926 A. fumigatus noin 12,071 A. oryzae. A. Nigerin entsyymiä tuottavan kannan genomikoko on keskikoko 33,9 Mb.
Vastaa