Kiinteä Kalvo Proteiineja

Kiinteä Kalvo Proteiineja

Kiinteä kalvo proteiineja (IMPs) toimivat yhdyskäytäviä soluja. Kaikki soluja ja soluelimiin ovat koteloitu läpäisemättömällä lipidi-kaksoiskerroksen ja IMPs meidän tutkimus on upotettu nämä kalvot. Ne ovat monien ionien, ravintoaineiden, jätetuotteiden, hormonien, lääkkeiden ja suurten molekyylien kuten proteiinien ja DNA: n tulo-ja poistumisreittejä. Ne ovat myös vastuussa suuresta osasta solujen ja ympäristön välistä viestintää., Solut voivat tehdä valtava valikoima näitä proteiineja, noin 30% geenien ihmisen genomin koodi kalvo proteiineja, ja kuitenkin tiedämme suhteellisen vähän siitä, nämä molekyylit.

Kalvon proteiinit ovat valitettavasti tunnetusti vaikea käsitellä ja tutkia, koska ne on suunniteltu istua sisällä hydrofobisia ympäristön rasva bilayer. Ne ovat yleensä epävakaita, kun ne uutetaan kotimaisesta ympäristöstään, ja meidän on lisättävä pesuaineita hydrofobisen pinnan peittämiseksi., Voidakseen ymmärtää ja ohjata toimintaa näiden proteiinien on välttämätöntä saada tietoa niiden kolmiulotteinen rakenne, joka on yleensä saatu X-ray crystallography. Kuitenkin vaikeus käsitellä näitä proteiineja on ollut vaikea ratkaista rakenteita, ja tähän mennessä on vähemmän kuin 300 rakenteiden kalvo proteiineja tiedossa, alle 0,5 % kaikista tunnetuista rakenteista. Korkeampi eukaryooteissa tarina on jopa enemmän stark, vain 20 rakenteet ihmisen IMPs ja vähemmän kuin 50 nisäkkäiden IMPs ratkaista., Kalvoproteiinit ovat näin ollen yksi tärkeimmistä jäljellä olevista rakenteellisen biologian tutkimuksen rajoista. KOMENTOKESKUKSESSA nyt sovellamme meidän state-of-the-art, suurikapasiteettisten menetelmiä voittaa pullonkaulat kalvo proteiini tutkimus, jotta voimme luotettavasti toimittaa puhdasta kalvo proteiini näytteitä ja rakenteita näiden kiehtova ja lääketieteellisesti kriittisen molekyylejä.

lääketieteellistä merkitystä

tämän valtavan proteiiniperheen lääketieteellistä merkitystä ei voida yliarvioida., Mutaatiot kalvon proteiinit ovat mukana monia yhteisiä sairauksia, kuten sydän-sairaus, jossa huonosti ioni-kanavat ovat usein osallisena. Kalsiumkanaviin kohdennetut lääkkeet voivat hallita muun muassa korkeaa verenpainetta ja angina pectorista. Kalvoproteiinit ovat mukana syövässä, jossa signalointireittien virheet voivat johtaa solujen jakautumiseen hallitsemattomasti. Usein erityisiä kalvon proteiinit ovat ylituotetulta syöpäsoluissa, ja siksi tavoitteet lääkehoito. Aivojen sairauksia, kuten migreeni, masennus ja Alzheimerin tauti ovat kaikki liittyy ongelmia kuljettajien ja kanavia., Kystinen fibroosi aiheutuu mutaatioista kystinen fibroosi läpäisevä johtokyky säädin (CFTR) geeni, joka koodaa kloridi-ioni-kanava.

Koska monet kalvo proteiineja istua pinnan solut, ne ovat helposti saatavilla pienimolekyylisiä lääkkeitä veressä. Siksi ei ole yllättävää, että yli 50% pienmolekyyleillä sitoutuvat solukalvon proteiineja. G-proteiini-reseptoreihin ja kanavat ovat tässä suhteessa erityisen tärkeitä, mutta ABC kuljettajat ja liuenneen aineen harjoittajat ovat myös tavoitteet lääkehoito., Ymmärrystä monia muita sairauksia, ja meidän kyky näiden sairauksien hoitoon olisi hyötyä enemmän rakenteellisia ja toiminnallisia tietoja proteiinien mukana. Toivomme, että ratkaisemalla rakenteiden nämä proteiinit, ymmärrystä taustalla biokemian ja vuorovaikutus substraatit ja inhibiittorit, voimme tarjota tehokkaampia hoitoja monia sairauksia.

SGC ja kiinteä kalvo proteiineja

SGC on laaja kokemus ratkaisemaan rakenteet liukoisen ihmisen proteiineja käyttämällä erittäin tehokkaita, korkean suoritustehon järjestelmissä., Kahden viime vuoden aikana olemme mukauttaneet näitä menetelmiä ihmisen kalvoproteiinien rakenteiden ratkaisemiseen. Meillä on turvatarkastus 186 ihmisen kalvo proteiineja erilaiset perheet, valitsemalla sarja rakentaa kunkin proteiinia, tunnistaa sopivia pesuaineita puhdistukseen ja sitten skaalaus ylös purificaiton ja kiteytyvä nämä proteiinit. Olemme kiteyttäneet 3 kalvoproteiinia ja ratkaisseet ensimmäisen rakenteemme, prosessin, joka kesti alle kaksi vuotta ensimmäisestä kloonista rakenteeseen.,

olemme ratkaisseet ihmisen ABC-kuljettajaproteiinin ensimmäisen rakenteen, luokan proteiineja, jotka osallistuvat pienmolekyylien kuljetukseen, monilääkeresistenssiin ja sairauksiin, kuten kystiseen fibroosiin ja diabetekseen. Ensimmäinen onnistunut kohteemme on ihmisen mitokondrion ABC-kuljettaja, ABCB10, joka on upotettu mitokondrioiden sisäkalvoon. ABCB10 on yli-ilmennetään aikana punasolujen erilaistumista, prosessi, joka muodostaa punasoluja. sitä esiintyy liikaa luuytimessä, sydämessä ja maksassa., Nyt on olemassa näyttöä siitä, että kun ABCB10 ilmaus pelkistetään soluissa, ne ovat enemmän alttiita oksidatiivisen stressin ja että ABCB10 voi olla mukana suojella sydän aikana sydänkohtaus.

teknologiat IMPs

: n tutkimiseen kehitämme geneerisiä menetelmiä, jotka mahdollistavat ihmisen kalvoproteiinien rakenteiden suuren läpimenon. Valitsimme baculovirus / hyönteissoluilmaisujärjestelmän, joka tarjoaa lipidikoostumuksen lähelle ihmissolujen koostumusta ja on todistettu suuri läpimenoalusta., Kunkin kohde-proteiini luomme joukon konstruktioita eripituisia ja eri affiniteetti tunnisteet, mukaan lukien täyspitkä geeni ja sarjan truncations poistaa mahdollisesti sekainen alueilla. Korkea suoritusteho ilmaisun näyttö on tunnistaa proteiineja, joita voidaan käyttää puhdistamaan milligramma määriä IMPS varten kiteyttämällä. Kukin proteiini on aluksi puhdistettu dodecyl maltoside (DDM) pesuainetta ja myöhemmin seulotaan vakaus-sarjassa eri pesuaineita tunnistaa optimaaliset olosuhteet vakaus-ja kiteyttämällä.,

Olemme luoneet menetelmiä korkea suoritusteho nanodrop kiteyttämällä ja manipulointi hauras kalvo proteiini kiteitä. Olemme kehittäneet tehokkaita järjestelmiä seulonnan kalvo proteiini kristalli diffraktio laatu menetelmä kiteytymisen conditon optimointi. Meillä on myös optimoitu meidän tietojen kerääminen ja analysointi diffraktio tietoja käyttämällä voimakas synkrotronisäteilyn microfocus beamlines, saatavilla osoitteessa resursseja, kuten Diamond Light Source Oy, Oxfordshiressä., Mahdollisuuksien kiteyttämällä suoritetaan sitoo ligandeja ja estäjät kaapata yhden natiivi konformaatio ja tarjota avain oivalluksia toiminto ja niiden suunnittelu. Aiomme myös tuottaa vasta-ainefragmentteja vastaan meidän puhdistettuja proteiineja käytettäväksi affiniteetti reagenssit ja kiteyttämällä aids.