Neandertalin DNA korostaa monimutkaisuus COVID riskitekijät

posted in: Articles | 0

keskeinen osa puuttumalla COVID-19 on ymmärtää, miksi jotkut ihmiset kokevat enemmän-vakavia oireita kuin muilla. Aiemmin tänä vuonna, segmentti DNA 50,000 nukleotidien pitkä (vastaa 0,002% ihmisen genomin) havaittiin voimakas assosiaatio, joilla on vaikea COVID-19 infektio ja hospitalization1. Writing in Nature, Zeberg ja Pääbo2 kertovat alueen periytyvän Neandertalilaisilta., Niiden tuloksia ei vain valottaa yksi syy, että jotkut ihmiset ovat alttiimpia vakava sairaus, mutta myös tarjota oivalluksia ihmisen evoluutiobiologian.

perimässä fyysisesti lähellä toisiaan olevat DNA-sekvenssit periytyvät (linkittyvät) usein keskenään. Nämä haplotyypeiksi kutsutut DNA-lohkot sisältävät siis tiukasti toisiinsa liittyviä variantteja — DNA-sekvenssejä tai nukleotideja, jotka vaihtelevat populaation yksilöiden välillä., Esimerkiksi COVID-19 riski haplotyyppi on kuvattu aiemmin tässä tulos1 satamat variantteja sen koko on 50 000-nukleotidin span jotka periytyvät yhdessä yli 98% ajasta. Pitkä haplotyypit, kuten tämä voisi olla seurausta positiivinen valinta, ylläpidetään meidän genomit, koska ne osaltaan lajimme selviytymismahdollisuuksia ja lisääntymisen onnistumiseen. He voisivat myös ottaa käyttöön seurauksena risteytyminen arkaainen hominin lajeja, kuten Denisovans ja Neanderthals.

noin 1-4% nykyihmisen perimästä tulee näistä muinaisista relativesistä3., Monet elossa arkaainen geenit ovat haitallisia nykyajan ihmiset, ja liittyy hedelmättömyyttä, ja lisääntynyt riski disease4. Mutta muutamat ovat hyödyllisiä. Esimerkkejä ovat Denisovan-kuten version geeni nimeltä EPAS1, joka auttaa moderni Tiibetiläiset selviytymään elämän erittäin korkea altitudes5, Neandertalin geeni, joka lisää herkkyyttä pain6 ja muut, jotka auttavat meitä päästämään irti viruses7.,

tutkia, onko COVID-19 riski haplotyyppi saattaa olla otettu käyttöön meidän muinaiset sukulaiset, Zeberg ja Pääbo verrattuna alue online-tietokanta arkaainen genomien ympäri maailmaa. He löysivät alueen läheisesti, että genomissa Neandertalin henkilö, joka asuivat nyky-Kroatia noin 50 000 vuotta sitten, mutta se ei liity mitään tunnettuja Denisovan genomit.

tekijät tarkastivat seuraavaksi neandertalinihmisen haplotyypin yleisyyden nykyihmisessä., He kertovat, että itäaasialaisilla ja afrikkalaisilla se on harvinainen tai kokonaan poissa. Latinalaisamerikkalaisten ja eurooppalaisten keskuudessa haplotyypin riski säilyy vaatimattomana (4% ja 8%). Sen sijaan haplotyyppi esiintyy taajuudella 30% henkilöillä, jotka ovat etelä-Aasian syntyperä, päästä niin korkea kuin 37% niistä, joilla Bangladeshin heritage (Fig. 1).

Kuva 1 | Epätasainen maailmanlaajuinen leviäminen geneettinen riskitekijä COVID-19., Zeberg ja Pääbo2 kertovat, että neandertalilaisista on peräisin pitkä DNA-sekvenssi, joka liittyy vakavaan COVID-19-infektioon ja sairaalahoitoon. Sekvenssi jakautuu epätasaisesti nykyihmisten populaatioiden kesken. Kartta näyttää, kuinka usein riskitekijä esiintyy eri populaatioissa eri puolilta maailmaa. Näiden populaatioiden jaksottamistiedot kerättiin 1000 Genomihankkeesta10. (Muokattu viikunasta. 3 of ref. 2.,)

tutkijat siis spekuloida, että Neandertalin-johdettu haplotyyppi on merkittävä tekijä COVID-19 riski tiettyjä ryhmiä. Heidän hypoteesi tukee sairaalan data8 Office for National Statistics Yhdistyneessä Kuningaskunnassa, joka osoittaa, että yksilöiden Bangladeshilaista alkuperää maassa ovat kaksi kertaa niin todennäköisesti kuolee COVID-19 kuin ovat jäseniä väestössä (vaikka muita riskitekijöitä on, tietenkin, edistää näiden tilastot).,

miksi tämä haplotyyppi on säilynyt joissakin populaatioissa? Kirjoittajat olettavat, että se voisi olla suojaava vastaan muut antiikin taudinaiheuttajia, ja siksi positiivisesti valittu tiettyjen väestöryhmien ympäri world9. Mutta kun ihmiset ovat tartunnan SARS-CoV-2 coronavirus, suojaava immuunivaste välittyvät nämä muinaiset geenejä saattaa olla liian aggressiivinen, mikä johtaa mahdollisesti kuolemaan johtava immuunivasteen havaittiin ihmiset, jotka kehittävät vakavia COVID-19 oireita., Tämän seurauksena haplotyyppi, että joskus menneisyydessä on saattanut hyödyttää selviytymisen voisi nyt olla kielteinen vaikutus.

Vaikka korrelaatio tämä riskin haplotyyppi ja kliinisiä tuloksia, geenit eivät yksin määrittää henkilön riski sairastua vakavia COVID-19. Geenimme ja niiden alkuperä vaikuttavat selvästi COVID-19: n (ja muiden tartuntatautien) kehittymiseen ja etenemiseen, mutta ympäristötekijöillä on myös keskeinen rooli taudin lopputuloksissa.,

esimerkiksi, vaikka Neandertalin-johdettu riski haplotyyppi on lähes kokonaan poissa ihmisiä, joilla on Afrikkalainen syntyperä, tämä väestö on suurempi COVID-19 kuolleisuus kuin ihmiset muita etnisiä taustoja, vaikka säätämisen jälkeen maantiede ja sosiaalis-taloudellisia tekijöitä (ks. go.nature.com/3jcxezx (’Demografia-välilehti) ja go.nature.com/2h4qfqu, esimerkiksi). Yhteiskunnallinen epätasa-arvo ja sen jälkiseuraukset näyttävät selittävän COVID-19-kuoleman riskistä suuremman osan kuin neandertalilaisen DNA: n.,

on kiehtovaa ajatella, että esi-isämme geeniperimä saattaa olla mukana nykyisessä pandemiassa. Perityn DNA: n perimmäinen vaikutus elimistön vasteeseen virukseen on kuitenkin epäselvä. Käynnissä olevia kansainvälisiä pyrkimyksiä tutkia yhdistysten välillä meidän genetiikka ja COVID-19 analysoimalla enemmän yksilöitä alkaen eri väestöryhmien, kuten ajamien COVID-19 Host Genetiikan Aloite (www.covid19hg.org), auttaa meitä ymmärtämään paremmin taudin etiologia on., On tärkeää tunnustaa, että vaikka geenit mukana COVID-19 vastaus saattaa olla perinnöllinen, sosiaaliset tekijät ja käyttäytymistä (kuten sosiaalista etäisyyttä ja naamio yllään) ovat meidän hallinnassamme, ja voi tehokkaasti vähentää infektion riskiä.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista. Pakolliset kentät on merkitty *