Aspergillus (Français)

a., nidulans (Emericella nidulans) a été utilisé comme organisme de recherche pendant de nombreuses années et a été utilisé par Guido Pontecorvo pour démontrer la parasexualité chez les champignons. Récemment, A. nidulans a été l’un des organismes pionniers à avoir son génome séquencé par des chercheurs du Broad Institute. En 2008, sept autres espèces D’Aspergillus ont vu leurs génomes séquencés: A. niger (deux souches), A. oryzae et A. terreus, et les pathogènes A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus et A. fumigatus (deux souches). A., fischerianus n’est presque jamais pathogène, mais est très étroitement lié à L’agent pathogène commun A. fumigatus; il a été séquencé en partie pour mieux comprendre la pathogénicité d’A. fumigatus.

reproduction Sexuellemodifier

sur les 250 espèces d’aspergilli, environ 64% n’ont pas d’état sexuel connu. Cependant, beaucoup de ces espèces ont probablement un stade sexuel encore non identifié. La reproduction sexuée se produit de deux manières fondamentalement différentes chez les champignons., Il s’agit d’affleurements (chez les champignons hétérothalliques) dans lesquels deux individus différents contribuent aux noyaux, et d’autofécondation ou d’autofécondation (chez les champignons homothalliques) dans lesquels les deux noyaux sont dérivés du même individu. Ces dernières années, des cycles sexuels ont été découverts chez de nombreuses espèces que l’on pensait auparavant asexuées. Ces découvertes reflètent l’accent expérimental récent sur les espèces particulièrement pertinentes pour l’homme.

A. fumigatus est l’espèce la plus courante pour causer des maladies chez les humains immunodéficients. En 2009, A. fumigatus s’est avéré avoir un cycle sexuel hétérothallique et entièrement fonctionnel., Des isolats de types d’accouplement complémentaires sont nécessaires pour que le sexe se produise.

A. flavus est le principal producteur d’aflatoxines cancérigènes dans les cultures du monde entier. C’est également un agent pathogène opportuniste humain et animal, provoquant l’aspergillose chez les individus immunodéprimés. En 2009, un état sexuel de ce champignon hétérothallique a été constaté lorsque des souches de types d’accouplement opposés ont été cultivées ensemble dans des conditions appropriées.

A. lentulus est un pathogène humain opportuniste qui provoque une aspergillose invasive avec des taux de mortalité élevés. En 2013, A., lentulus s’est avéré avoir un système de reproduction sexuelle fonctionnel hétérothallique.

A. terreus est couramment utilisé dans l’industrie pour produire des acides organiques et des enzymes importants, et était la source initiale du médicament hypocholestérolémiant la lovastatine. En 2013, A. terreus s’est avéré capable de se reproduire sexuellement lorsque des souches de types d’accouplement opposés ont été croisées dans des conditions de culture appropriées.,

ces résultats avec des espèces D’Aspergillus concordent avec l’accumulation de preuves, provenant d’études sur d’autres espèces eucaryotes, que le sexe était probablement présent chez l’ancêtre commun de tous les eucaryotes.

A. nidulans, un champignon homothallique, est capable d’autofécondation. L’autofécondation implique l’activation des mêmes voies d’accouplement caractéristiques du sexe chez les espèces en croisement, c’est-à-dire que l’autofécondation ne contourne pas les voies requises pour le sexe en croisement, mais nécessite plutôt l’activation de ces voies chez un seul individu.,

parmi les espèces D’Aspergillus qui présentent un cycle sexuel, la grande majorité dans la nature sont homothalliques (autofécondation). Cette observation suggère que les espèces D’Aspergillus peuvent généralement maintenir le sexe bien que peu de variabilité génétique soit produite par l’autofécondation homothallique. A., fumigatus, un champignon hétérothallique (affleurant) qui se produit dans des zones avec des climats et des environnements très différents, présente également peu de variabilité génétique à l’intérieur des régions géographiques ou à l’échelle mondiale, suggérant encore une fois que le sexe, dans ce cas, le sexe affleurant, peut être maintenu même lorsque peu de variabilité génétique est produite.

Génomiquemodifier

la publication simultanée de trois manuscrits du génome D’Aspergillus dans Nature en décembre 2005 a établi le genre comme le principal genre fongique filamenteux pour les études génomiques comparatives., Comme la plupart des grands projets génomiques, ces efforts étaient des collaborations entre un grand centre de séquençage et la communauté respective de scientifiques. Par exemple, L’Institute for Genome Research (TIGR) a travaillé avec la communauté d’A. fumigatus. A. nidulans a été séquencé au Broad Institute. A. oryzae a été séquencé au Japon à l’Institut national des Sciences et Technologies Industrielles Avancées. Le Joint Genome Institute du Département de l’énergie a publié des données de séquence pour une souche productrice d’acide citrique D’A. niger. TIGR, maintenant renommé Le J., Craig Venter Institute, dirige actuellement un projet sur le génome d’A. flavus.

Aspergillus est caractérisé par des niveaux élevés de diversité génétique et, en utilisant la divergence des protostomes comme échelle, est aussi diversifié que le phylum des vertébrés bien que la structure du génome inter et intra-spécifique soit relativement plastique. Les génomes de certaines espèces D’Aspergillus, comme A. flavus et A. oryzae, sont plus riches et environ 20% plus grands que d’autres, comme A. nidulans et A. fumigatus., Plusieurs mécanismes pourraient expliquer cette différence, bien que la combinaison de duplication segmentaire, de duplication génomique et de transfert horizontal de gènes agissant de manière fragmentaire soit bien étayée.

La Taille du génome des espèces séquencées d’Aspergillus varie d’environ 29,3 Mo pour A. fumigatus à 37,1 Mo pour A. oryzae, tandis que le nombre de gènes prédits varie d’environ 9926 pour A. fumigatus à environ 12 071 Pour A. oryzae. La taille du génome d’une souche productrice d’enzymes D’A. niger est de taille intermédiaire à 33,9 Mb.