un élément clé de la lutte contre COVID-19 est de comprendre pourquoi certaines personnes présentent des symptômes plus graves que d’autres. Plus tôt cette année, un segment D’ADN long de 50 000 nucléotides (correspondant à 0,002% du génome humain) s’est avéré fortement associé à une infection et à une hospitalisation graves liées à la COVID-191. Dans Nature, Zeberg et Pääbo2 rapportent que cette région est héritée des Néandertaliens., Leurs résultats éclairent non seulement une des raisons pour lesquelles certaines personnes sont plus sensibles aux maladies graves, mais fournissent également des informations sur la biologie évolutive humaine.
Les séquences d’ADN qui sont physiquement proches les unes des autres dans le génome sont souvent héritées (liées) ensemble. Ces blocs D’ADN, appelés haplotypes, contiennent donc des variantes étroitement liées — des séquences D’ADN ou des nucléotides qui varient entre les individus d’une population., Par exemple, l’haplotype de risque COVID-19 décrit plus tôt cette année1 comporte des variantes sur toute sa durée de 50 000 nucléotides qui sont héritées ensemble plus de 98% du temps. De longs haplotypes comme celui-ci pourraient être le résultat d’une sélection positive, maintenue dans nos génomes parce qu’ils ont contribué aux chances de survie et de succès reproductif de notre espèce. Ils pourraient également être introduits à la suite d’un métissage avec des espèces d’hominines archaïques telles que les Denisovans et les Néandertaliens.
environ 1 à 4% du génome humain moderne provient de ces anciens parents3., Bon nombre des gènes archaïques survivants sont nocifs pour l’homme moderne et sont associés à l’infertilité et à un risque accru de maladie4. Mais quelques-uns sont bénéfiques. Les exemples incluent la version de type Denisovan d’un gène appelé EPAS1 qui aide les Tibétains modernes à faire face à la vie à des altitudes5 extrêmement élevées, un gène néandertalien qui augmente notre sensibilité à la douleur6 et d’autres qui nous aident à repousser les virus7.,
pour déterminer si l’haplotype de risque COVID-19 pourrait avoir été introduit par nos anciens parents, Zeberg et Pääbo ont comparé la région avec une base de données en ligne de génomes archaïques du monde entier. Ils ont constaté que la région était étroitement liée à celle du génome d’un individu Néandertalien qui vivait dans la Croatie moderne il y a environ 50 000 ans, mais elle n’était liée à aucun génome Dénisovien connu.
Les auteurs ont ensuite vérifié la prévalence de L’haplotype dérivé de Néandertal dans la population humaine moderne., Ils rapportent qu’il est rare ou complètement absent chez les Asiatiques de l’est et les Africains. Chez les latino-américains et les Européens, l’haplotype de risque est maintenu à une fréquence modeste (4% et 8%, respectivement). En revanche, l’haplotype se produit à une fréquence de 30% chez les individus d’ascendance Sud-Asiatique, atteignant jusqu’à 37% chez ceux d’origine bangladaise (Fig. 1).
Figure 1 / propagation mondiale inégale d’un facteur de risque génétique pour COVID-19., Zeberg et Pääbo2 rapportent qu’une longue séquence D’ADN associée à une infection grave à COVID-19 et à une hospitalisation provient de Néandertaliens. La séquence est inégalement répartie entre les populations humaines modernes. Cette carte montre la fréquence à laquelle le facteur de risque est trouvé dans diverses populations du monde entier. Les données de séquençage de ces populations ont été recueillies dans le cadre du projet 1000 Génomes 10. (Adapté à partir de la Fig. 3 de réf. 2.,)
Les chercheurs supposent donc que L’haplotype dérivé de Néandertal contribue de manière substantielle au risque de COVID-19 dans des groupes spécifiques. Leur hypothèse est étayée par les données hospitales8 de L’Office for National Statistics au Royaume-Uni, qui indique que les personnes D’origine bangladaise dans le pays sont deux fois plus susceptibles de mourir de COVID-19 que les membres de la population générale (bien que d’autres facteurs de risque contribuent, bien sûr, à ces statistiques).,
pourquoi cet haplotype a-t-il été conservé dans certaines populations? Les auteurs supposent qu’il pourrait être protecteur contre d’autres pathogènes anciens, et donc positivement sélectionné pour dans certaines populations à travers le monde9. Mais lorsque des individus sont infectés par le coronavirus SARS-CoV-2, la réponse immunitaire protectrice médiée par ces anciens gènes peut être trop agressive, conduisant à la réponse immunitaire potentiellement mortelle observée chez les personnes qui développent des symptômes graves de COVID-19., En conséquence, un haplotype que parfois dans notre passé qui aurait pu être bénéfique pour la survie pourrait maintenant avoir un effet négatif.
Malgré la corrélation entre cet haplotype de risque et les résultats cliniques, la génétique seule ne détermine pas le risque d’une personne de développer une COVID-19 sévère. Nos gènes et leurs origines influencent clairement le développement et la progression de la COVID-19 (et d’autres maladies infectieuses), mais les facteurs environnementaux jouent également un rôle clé dans les résultats de la maladie.,
par exemple, bien que l’haplotype de risque dérivé de Néandertal soit presque complètement absent chez les personnes D’ascendance africaine, cette population a un taux de mortalité COVID-19 plus élevé que les personnes d’autres origines ethniques, même après ajustement pour les facteurs géographiques et socio-économiques (voir go.nature.com/3jcxezx (onglet ‘démographie’) et go.nature.com/2h4qfqu, par exemple). L’inégalité sociale et ses répercussions semblent probablement expliquer une plus grande proportion du risque de décès par COVID-19 que l’ADN dérivé de Néandertal.,
Il est fascinant de penser que l’héritage génétique de notre ancêtre pourrait jouer un rôle dans la pandémie actuelle. Cependant, l’impact sous-jacent de l’ADN hérité sur la réponse du corps au virus n’est pas clair. Efforts mondiaux en cours pour étudier les associations entre notre génétique et COVID-19 en analysant plus d’individus de populations diverses, comme celui entrepris par L’initiative COVID – 19 Host Genetics (www.covid19hg.org), nous aidera à développer une meilleure compréhension de l’étiologie de la maladie., Il est important de reconnaître que, bien que les gènes impliqués dans la réponse à la COVID-19 puissent être hérités, les facteurs sociaux et les comportements (tels que la distanciation sociale et le port du masque) sont sous notre contrôle et peuvent réduire efficacement le risque d’infection.
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