Aspergillus (Norsk)

A., nidulans (Emericella nidulans) har blitt brukt som et forsknings-organisme i mange år, og ble brukt av Guido Pontecorvo å demonstrere parasexuality i sopp. Nylig, A. nidulans var en av de banebrytende organismer for å få sitt genom sekvensert av forskere ved Broad Institute. Som i 2008, en ytterligere syv Aspergillus arter har hatt sine sekvensert genomet: industrielt nyttig A. niger (to stammer), A. oryzae, og A. terreus, og patogener A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus og A. fumigatus (to stammer). A., fischerianus er neppe noen gang patogene, men er veldig nært knyttet til de vanligste patogene A. fumigatus, det ble sekvensert i en del for å bedre forstå A. fumigatus pathogenicity.

Seksuelle reproductionEdit

Over 250 arter av aspergilli, om 64% har ingen kjente seksuell tilstand. Imidlertid, mange av disse artene er trolig har en hittil uidentifisert seksuell scenen. Seksuell reproduksjon skjer i to fundamentalt forskjellige måter i sopp., Disse er utparringer (i heterothallic sopp) som to forskjellige individer bidra kjerner, og selv befruktning eller selfing (i homothallic sopp) som begge kjerner er avledet fra samme individ. I de siste årene, seksuell sykluser har blitt oppdaget i en rekke arter som tidligere er antatt å være asexual. Disse funnene reflekterer nyere eksperimentelle fokus på arter av spesiell relevans for mennesker.

A. fumigatus er de vanligste artene å forårsake sykdom i immunodeficient mennesker. I 2009, A. fumigatus ble vist å ha en heterothallic, fullt funksjonell seksuelle syklus., Isolater av komplementære parring typer er nødvendig for at sex skal skje.

A. flavus er den største produsent av kreftfremkallende aflatoxins i avlinger over hele verden. Det er også en opportunistisk mennesker og dyr patogen, forårsaker aspergillosis i immunsupprimerte individer. I 2009, en seksuell staten i denne heterothallic sopp ble funnet å fremkomme når tolkningene av motsatt parring typer ble dyrket sammen under egnede forhold.

A. lentulus er en opportunistisk menneskelige organismen som forårsaker skadelige aspergillosis med høy dødelighet. I 2013, A., lentulus ble funnet å ha en heterothallic funksjonelle seksuell formering system.

A. terreus er mye brukt i industrien for å produsere viktige organiske syrer og enzymer, og var den første kilden for kolesterolsenkende medikament lovastatin. I 2013, A. terreus ble funnet å være i stand til seksuell reproduksjon når tolkningene av motsatt parring typer ble krysset under egnede kultur betingelser.,

Disse funnene med Aspergillus arter er konsistente med å samle bevis, fra studier av andre eukaryote arter, som sex, noe som trolig var til stede i den felles stamfar av alle eukaryotes.

A. nidulans, en homothallic sopp, er i stand til selv-befruktning. Selfing innebærer aktivering av samme parring trasé karakteristisk for sex i utparringer arter, det vil si selv-befruktning gjør bypass ikke nødvendig trasé for utparringer sex, men i stedet krever aktivering av disse trasé innenfor et enkelt individ.,

Blant de Aspergillus arter som viser seksuelle syklus, det overveldende flertallet i naturen er homothallic (self-gjødsling). Denne observasjonen tyder på Aspergillus arter kan vanligvis opprettholde sex selv om lite genetisk variasjon er produsert av homothallic selv-befruktning. A., fumigatus, en heterothallic (utparringer) sopp som oppstår i områder med mye forskjellig klima og miljø, også viser liten genetisk variasjon enten innenfor geografiske regioner eller på en global skala, igjen noe som tyder på sex, i dette tilfellet utparringer sex, kan opprettholdes selv når lite genetisk variasjon er produsert.

GenomicsEdit

samtidig publisering av tre Aspergillus genom manuskripter i Naturen i desember 2005 etablert slekten som den ledende trådformede fungal slekten for komparativ genomisk studier., Som de fleste store genom prosjekter, dette arbeidet var et samarbeid mellom et stort sekvensering sentrum og de respektive fellesskap av forskere. For eksempel, Institutt for Genome Research (TIGR) jobbet med A. fumigatus samfunnet. A. nidulans ble sekvensert ved Broad Institute. A. oryzae ble sekvensert i Japan ved National Institute of Advanced Industrial Science and Technology. Felles Genome Institute of Department of Energy har gitt en sekvens av data for en sitronsyre-produserende stammer av A. niger. TIGR, nå omdøpt til J., Craig Venter Institute, er foreløpig helt i front i et prosjekt på A. flavus genom.

Aspergillus er preget av høye nivåer av genetisk mangfold og, ved hjelp av protostome divergens som en skala, er like forskjellige som Vertebrater phylum selv om både inter-og intra-spesifikke genom struktur er relativt plast. Den genomet til noen Aspergillus-arter, for eksempel A. flavus og A. oryzae, er mer rik og rundt 20% større enn andre, som for eksempel A. nidulans og A. fumigatus., Flere mekanismer kan forklare denne forskjellen, selv om kombinasjonen av segmental duplisering, genom duplisering, og horisontal overføre genet opptrer i en stykkevis mote er godt støttet.

Genom størrelser for sekvensert arter av Aspergillus varierer fra ca 29.3 Mb for A. fumigatus å 37.1 Mb for A. oryzae, mens tallene for spådd gener varierer fra rundt 9926 for A. fumigatus til om 12,071 for A. oryzae. Den genomstørrelse av et enzym-produserende stammer av A. niger er av middels størrelse på 33.9 Mb.