Aspergillus (Română)

A., nidulans (Emericella nidulans) a fost folosit ca organism de cercetare de mai mulți ani și a fost folosit de Guido Pontecorvo pentru a demonstra parasexualitatea în ciuperci. Recent, A. nidulans a fost unul dintre organismele de pionierat care și-a secvențiat genomul de către cercetătorii de la Institutul Broad. Începând din 2008, mai mult de șapte speciile de Aspergillus au genomuri secvențiate: industrial utile A. niger (două tulpini), A. oryzae, A. terreus, și agenți patogeni A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus și A. fumigatus (două tulpini). A., fischerianus este aproape niciodată patogen, dar este foarte strâns legat de agentul patogen comun A. fumigatus; a fost secvențiat parțial pentru a înțelege mai bine patogenitatea A. fumigatus.din cele 250 de specii de aspergilli, aproximativ 64% nu au o stare sexuală cunoscută. Cu toate acestea, multe dintre aceste specii au probabil un stadiu sexual încă neidentificat. Reproducerea sexuală are loc în două moduri fundamental diferite în ciuperci., Acestea sunt outcrossing (în heterothallic ciuperci), în care două persoane diferite contribuie nuclee, și de auto-fertilizare sau selfing (în homothallic ciuperci), în care ambele nuclee sunt derivate de la același individ. În ultimii ani, ciclurile sexuale au fost descoperite în numeroase specii despre care se credea anterior că sunt asexuale. Aceste descoperiri reflectă concentrarea experimentală recentă asupra speciilor de relevanță deosebită pentru oameni.A. fumigatus este cea mai frecventă specie care provoacă boala la oamenii imunodeficienți. În 2009, s-a demonstrat că A. fumigatus are un ciclu sexual heterotalic, complet funcțional., Izolatele de tipuri complementare de împerechere sunt necesare pentru ca sexul să apară.A. flavus este principalul producător de aflatoxine cancerigene în culturile din întreaga lume. Este, de asemenea, un patogen oportunist uman și animal, provocând aspergiloză la persoanele imunocompromise. În 2009, sa constatat că o stare sexuală a acestei ciuperci heterotalice apare atunci când tulpinile de tipuri opuse de împerechere au fost cultivate împreună în condiții adecvate.A. lentulus este un agent patogen oportunist uman care provoacă aspergiloză invazivă cu rate ridicate de mortalitate. În 2013, A., lentulus sa dovedit a avea un sistem de reproducere sexuală funcțională heterotalică.A. terreus este frecvent utilizat în industrie pentru a produce acizi organici și enzime importante și a fost sursa inițială pentru medicamentul care scade colesterolul lovastatină. În 2013, sa constatat că A. terreus este capabil de reproducere sexuală atunci când tulpinile de tipuri opuse de împerechere au fost traversate în condiții de cultură adecvate.,aceste constatări cu specii de Aspergillus sunt în concordanță cu dovezile acumulate, din studiile altor specii eucariote, că sexul a fost probabil prezent în strămoșul comun al tuturor eucariotelor.A. nidulans, o ciupercă homotalică, este capabilă de auto-fertilizare. Selfing implică activarea aceeași împerechere căi caracteristice de sex în outcrossing specii, și anume auto-fertilizarea nu ocoli necesare căi pentru outcrossing sex, dar, în schimb necesită activare a acestor căi într-un singur individ.,printre acele specii de Aspergillus care prezintă un ciclu sexual, majoritatea covârșitoare în natură sunt homotalice (auto-fertilizare). Această observație sugerează că speciile de Aspergillus pot menține în general sexul, deși o mică variabilitate genetică este produsă prin auto-fertilizarea homotalică. A., fumigatus, un heterothallic (outcrossing) ciuperca care apare pe scară largă în zonele cu climate diferite și medii, afișează, de asemenea, mică variabilitate genetică, fie în regiuni geografice sau pe o scară globală, sugerând din nou sex, în acest caz outcrossing sex, poate fi menținută chiar și atunci când variabilitatea genetică este produsă.

GenomicsEdit

publicarea simultană a trei Aspergillus genomului manuscrise în Natură, în decembrie 2005 a stabilit genul ca lider filamentoase gen fungice pentru genomică comparativă studii., La fel ca majoritatea proiectelor majore de genom, aceste eforturi au fost colaborări între un mare centru de secvențiere și comunitatea de oameni de știință respectivă. De exemplu, Institutul pentru cercetarea genomului (TIGR) a lucrat cu comunitatea A. fumigatus. A. nidulans a fost secvențiat la Institutul Broad. A. oryzae a fost secvențiat în Japonia la Institutul Național de știință și Tehnologie Industrială avansată. Institutul comun al genomului al Departamentului de energie a lansat date de secvență pentru o tulpină producătoare de acid citric A. niger. TIGR, acum redenumit J., Institutul Craig Venter, conduce în prezent un proiect privind genomul A. flavus.Aspergillus se caracterizează prin niveluri ridicate de diversitate genetică și, folosind divergența protostomului ca scară, este la fel de diversă ca filumul vertebratelor, deși structura genomului inter și intra-specifică este relativ plastică. Genomii unor specii de Aspergillus, cum ar fi A. flavus și A. oryzae, sunt mai bogați și cu aproximativ 20% mai mari decât alții, cum ar fi A. nidulans și A. fumigatus., Mai multe mecanisme ar putea explica această diferență, deși combinația dintre duplicarea segmentară, duplicarea genomului și transferul orizontal de gene care acționează în mod fragmentat este bine susținută.dimensiunile genomului pentru speciile secvențiate de Aspergillus variază de la aproximativ 29,3 Mb pentru A. fumigatus la 37,1 Mb pentru A. oryzae, în timp ce numărul genelor prezise variază de la aproximativ 9926 pentru A. fumigatus la aproximativ 12,071 pentru A. oryzae. Dimensiunea genomului unei tulpini producătoare de enzime A. niger este de dimensiune intermediară la 33,9 Mb.