multe proteine „leagă” ADN – ul prin aminoacizii încărcați pozitiv pe suprafețele lor. Cu toate acestea, pentru a depăși obstacolele energetice și topologice semnificative, proteinele care îndoaie sau împachetează ADN-ul ar putea, de asemenea, să moduleze rigiditatea generată de repulsiile dintre fosfații din ADN., Mult de munca anterioare descrie cum ioni schimba flexibilitatea de ADN în soluție, dar atunci când se analizează macromolecule, cum ar fi cromatinei în care ADN-ul de contacte nucleosome core fiecare rândul său de dublu helix, poate fi mai adecvat pentru a evalua flexibilitatea ADN-ul de pe suprafețe încărcate. Mica acoperită cu molecule încărcate pozitiv este un substrat convenabil pe care flexibilitatea ADN-ului poate fi măsurată direct cu un microscop de forță de scanare., În experimentele descrise mai jos, flexibilitatea ADN-ului a crescut de cinci ori în funcție de concentrația și tipul de poliamină utilizat pentru acoperirea mica. Folosind teoria care se referă la neutralizarea sarcinii la flexibilitate, prezicem că repulsiile de fosfat au fost atenuate cu ∼50% în ADN-ul cel mai flexibil observat. Această metodă simplă este un instrument important pentru investigarea cauzelor fizico-chimice și a efectelor biologice moleculare ale flexibilității ADN-ului, care afectează biochimia ADN, de la stabilitatea cromatinei până la încapsularea virală.
Lasă un răspuns