Aspergillus (Svenska)

A., nidulans (Emericella nidulans) har använts som ett forsknings-organism under många år och användes av Guido Pontecorvo att visa parasexuality i svampar. Nyligen var A. nidulans en av de banbrytande organismerna för att få sitt genom sekvenserat av forskare vid Broad Institute. Från och med 2008 har ytterligare sju Aspergillus-arter har haft sina genom sekvenserat: industriellt användbara A. niger (två stammar), A. oryzae, och A. terreus, och patogener A. clavatus, A. fischerianus (Neosartorya fischeri), A. flavus och A. fumigatus (två stammar). A., fischerianus är knappast någonsin patogen, men är mycket nära relaterad till den gemensamma patogenen A. fumigatus; det sekvenserades delvis för att bättre förstå A. fumigatus patogenicitet.

sexuell reproductionEdit

av de 250 arterna aspergilli, har cirka 64% ingen känd sexuell stat. Men många av dessa arter har sannolikt ett ännu oidentifierat sexuellt Stadium. Sexuell reproduktion sker på två fundamentalt olika sätt i svampar., Dessa är outcrossing (i heterotalliska svampar) där två olika individer bidrar till kärnor och självbefruktning eller selfing (i homotalliska svampar) där båda kärnorna härrör från samma individ. Under de senaste åren har sexuella cykler upptäckts i många arter som tidigare tros vara asexuella. Dessa upptäckter återspeglar den senaste tidens experimentella fokus på arter av särskild betydelse för människor.

A. fumigatus är den vanligaste arten för att orsaka sjukdom hos människor med nedsatt immunförsvar. Under 2009 visades A. fumigatus ha en heterotallisk, fullt fungerande sexuell cykel., Isolat av komplementära parningstyper krävs för att sex ska uppstå.

A. flavus är den största producenten av cancerframkallande aflatoxiner i grödor över hela världen. Det är också en opportunistisk människa och djur patogen, orsakar aspergillos i immunkompromised individer. Under 2009 visade sig ett sexuellt tillstånd av denna heterotalliska svamp uppstå när stammar av motsatta parningstyper odlades tillsammans under lämpliga förhållanden.

A. lentulus är en opportunistisk mänsklig patogen som orsakar invasiv aspergillos med hög dödlighet. År 2013, A., lentulus befanns ha ETT heterotalliskt funktionellt sexuellt avelssystem.

A. terreus används ofta inom industrin för att producera viktiga organiska syror och enzymer, och var den ursprungliga källan för det kolesterolsänkande läkemedlet lovastatin. År 2013 befanns A. terreus vara kapabel till sexuell reproduktion när stammar av motsatta parningstyper korsades under lämpliga kulturförhållanden.,

dessa fynd med Aspergillus-arter stämmer överens med att det från studier av andra eukaryota arter fanns bevis för att kön troligen fanns i den gemensamma förfadern till alla eukaryoter.

A. nidulans, en homotallisk svamp, kan självbefruktning. Selfing innebär aktivering av samma parningsvägar som är karakteristiska för kön i outcrossing-arter, dvs självbefruktning kringgår inte nödvändiga vägar för outcrossing sex, utan kräver istället aktivering av dessa vägar inom en enda individ.,

bland de Aspergillus-arter som uppvisar en sexuell cykel är den överväldigande majoriteten i naturen homotallisk (självbefruktning). Denna observation tyder Aspergillus arter kan i allmänhet upprätthålla kön men lite genetisk variation produceras av homotallic självbefruktning. A., fumigatus, en heterotallisk (outcrossing) svamp som förekommer i områden med mycket olika klimat och miljöer, visar också liten genetisk variabilitet antingen inom geografiska regioner eller på global skala, vilket återigen tyder på sex, i detta fall outcrossing sex, kan bibehållas även när liten genetisk variabilitet produceras.

GenomicsEdit

den samtidiga publiceringen av tre Aspergillus genommanus i naturen i December 2005 fastställde släktet som det ledande filamentösa svampsläktet för jämförande genomiska studier., Liksom de flesta större genomprojekt var dessa ansträngningar samarbeten mellan ett stort sekvenseringscentrum och respektive forskargemenskap. Till exempel arbetade Institutet för genomforskning (TIGR) med A. fumigatus-samhället. A. nidulans sekvenserades vid Broad Institute. A. oryzae var analyserats i Japan vid National Institute of Advanced Industrial Science and Technology. Joint Genome Institute of the Department of Energy har släppt sekvensdata för en citronsyraproducerande stam av A. niger. TIGR, nu omdöpt J., Craig Venter Institute, är för närvarande spearheading ett projekt på A. flavus genome.

Aspergillus kännetecknas av höga nivåer av genetisk mångfald och, med hjälp av protostome divergens som en skala, är lika olika som ryggradsdjur fylum även om både inter och intra-specifik genomstruktur är relativt plast. Genomen av vissa Aspergillus-arter, som A. flavus och A. oryzae, är mer rika och omkring 20% större än andra, såsom A. nidulans och A. fumigatus., Flera mekanismer skulle kunna förklara denna skillnad, även om kombinationen av segmentduplicering, genomduplicering och horisontell genöverföring som verkar på ett styckevis sätt är välstödd.

Genomstorlekar för sekvenserade arter av Aspergillus varierar från ca 29,3 Mb för A. fumigatus till 37,1 Mb för A. oryzae, medan antalet förutsagda gener varierar från ca 9926 för A. fumigatus till ca 12 071 för A. oryzae. Genomstorleken hos en enzymproducerande stam av A. niger är av mellanstorlek vid 33,9 Mb.