många proteiner ”binder” DNA genom positivt laddade aminosyror på deras ytor. För att övervinna betydande energiska och topologiska hinder kan proteiner som böjer eller packar DNA också modulera styvheten som genereras av repulsioner mellan fosfater inom DNA., Mycket tidigare arbete beskriver hur joner förändrar flexibiliteten hos DNA i lösning, men när man överväger makromolekyler som kromatin där DNA kommer i kontakt med nukleosomkärnan varje varv av dubbelhelixen kan det vara lämpligare att bedöma flexibiliteten hos DNA på laddade ytor. Glimmer belagd med positivt laddade molekyler är ett bekvämt substrat på vilket flexibiliteten hos DNA kan mätas direkt med ett svepkraftmikroskop., I de experiment som beskrivs nedan ökade flexibiliteten hos DNA så mycket som femfaldigt beroende på koncentrationen och typen av polyamin som används för att belägga glimmer. Med hjälp av teori som relaterar laddningsneutralisering till flexibilitet förutspår vi att fosfatrepulsioner försvagades med 50% i det mest flexibla DNA som observerades. Denna enkla metod är ett viktigt verktyg för att undersöka de fysiokemiska orsakerna och molekylärbiologiska effekterna av DNA-flexibilitet, vilket påverkar DNA-biokemi som sträcker sig från kromatinstabilitet till viral inkapsling.
Lämna ett svar